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生物工程巨头1 CellBio与Partek合作,开发单细胞分析inDrop系统

Mailman 2019-01-25 14:30

博亿堂娱乐(公众号:vcbeat)获悉,单细胞分析巨头1 Cellbio和顶尖的生物信息软件公司Partek昨日合作发布了数据分析管道inDrop系统,它能顺利地在Partek Flow生物信息软件中运行。


该系统允许用户预处理原始的inDrop单细胞RNA-Seq数据,并使用Partek旗下先进的软件和可视化工具来描述和分析单个细胞。此外,有能力开发自定义inDrop应用程序的用户可以利用软件中提供的各种单细胞生物信息学工具,并使用直观的界面对其进行配置。


Partek旗下的单细胞RNA-Seq系统正在彻底改变复杂组织和疾病的研究,其可视化的特点和易于操作的指令工具使研究人员能够分析他们自己的单细胞RNA-Seq数据。首先,系统页面会使用交互式图表执行条形码和细胞过滤,以指导使用者的后续选择操作。其次,系统会自动叠加聚类结果、基因和途径表达、样本属性等,以帮助对3D t-SNE图上的细胞进行分类。最后,系统会自动识别细胞类型之间或治疗条件之间差异表达的基因和途径,有效节省研究人员的时间和精力。


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Partek Flow功能介绍页面


单细胞分析在生命科学界越来越受欢迎,并为生物工程和疾病治疗提供新颖的见解。它可用于多种应用,包括肿瘤分析、药物靶标验证、细胞间变异鉴定和谱系示踪。然而,生物信息学分析仍然是许多研究人员的难题,现有的传统解决方案已不能满足与日俱进的研究和应用需求。生物学界想要有所突破,就需要借用先进的计算机技术和内部信息学能力来弥补传统方案的不足。


现在,Partek Flow通过直观的点击界面使科学家能够轻松分析其scRNA-Seq数据,从而解决了这一问题。


当被问及合作伙伴关系时,Partek总裁Tom Downey表示:“与1CellBio合作的意义在于,我们为分析单细胞数据提供一种经济上负担得起且易于使用的解决方案,让科学家无需学习和使用过于专业的计算机技术就能尝试解决自己提出的研究问题。”


1 CellBio首席执行官Colin J.H. Brenan博士则表示:“他们不仅提供一流的scRNA-seq分析解决方案,随着我们引入更多的单细胞应用,他们还将不断地革新现有技术来满足我们的需求。”


关于Partek


Partek总部位于密苏里州圣路易斯,是一家为生命科学领域开发并分析软件和技术服务的公司。其产品在所有一代测序和微阵列平台方面皆是领先地位,超过7000篇同行评审的科学论文使用Partek软件简化了基因组研究的分析。Partek在推动生命科学研究方面可谓功不可没。


关于1Cellbio


1 CellBio是一家全球领先的单细胞分析公司,深耕生物医学研究领域。1CellBio由哈佛大学的顶尖科学家创建,总部位于马萨诸塞州剑桥市。


1 CellBio的旗舰产品inDrop™系统是具有高分辨率的单细胞转录组的平台,在行业领域内无出其右。目前,世界各地的研究实验室正在采用该平台进行广泛的单细胞应用,从肿瘤分析到干细胞,从胚胎发育到新药靶点的识别和验证。


注:文中如果涉及博亿堂娱乐记者采访的数据,均由受访者提供并确认。如果您有资源对接,联系报道项目,寻求合作等需求请填写 需求表

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